Вся территория госзаповедника разделена на 2 лесничества раздельно по каждой области:

1. Нуринское лесничество в границах Карагандинской области, разделена на 18 инспекторских обходов 158 кварталами и 2 инспекторских участка,

2. Коргалжынское лесничество разделено на 40 инспекторских обходов, 171 квартал и 3 инспекторских участка.

По периметру заповедника имеется охранная зона шириной в 2 километра, которая обозначена на местности аншлагами, в охранной зоне имеется 4 участка для сенокоса на нужды основных землепользователей, пастбища. На одном участке с северо-западной стороны ведется возделывание зерновых культур землепользователями Егындыколского района. Порядок и правила ведения хозяйственной деятельности строго контролируется госинспекторами службы охраны.

Распределение общей площади заповедника по административным районам

№ п/п	Административные районы в пределах области	Общая площадь запретной зоны (га)	Охранная зона 2 км (га)
1	Акмолинская область	281046	38581
1.1.	Коргалжынский район	281046	19251
1.2.	Егиндыкольский район	-//-	19330
2	Карагандинская область	262125	50779
2.1.	Нуринский район	262125	50779
Всего:		543171	89360